Mss di cui non si conosce la collocazione: G.A. Pujati, Favola pastorale; Id., Quattro tometti di osservazioni tratte dalla sua pratica.
G.A. PUJATI, Dissertazioni fisiche ed un’egloga intorno l’origine delle fontane, Venezia, Hertz, 1726; ID., De hydrargyri interno usu, Venezia, s.n.e., 1726 (citato dal DE RENZI); ID., Decas rariorum medicarum observationum, Venezia, Coletti, 1737; ID., De morbo naroniano tractatus, Feltre, Bordoni, 1747; ID., Riflessioni sul vitto pitagorico, Feltre, Foglietta, 1751; ID., Lettera di Giuseppe Antonio Pusati a suo figliuolo Anton-Gaetano studente di medicina in Padova, Venezia, Occhi, 1754 (Raccolta di opuscoli scientifici, a cura di A. CALOGERÀ), 125-227; ID., De victu febricitantium dissertatio, Padova, Seminario, 1758; ID., Della preservazione della salute de’ letterati, e della gente applicata e sedentaria, a cura di A.G. PUJATI, Venezia, Zatta, 1762 (= 17682); ID., Dissertationes medicae quinque nunc ab eius filio Antonio Caietano medicinae doctore editae. De hypothesibus a praxi medica explodendis. De methodo philosophandi in praxi medica. De locis medicis, eorumque usu. De putredine pro febrium multarum causa primum. De usu vini in febribus. De imaginaria dierum criticorum potentia, a cura di A.G. PUJATI, Venezia, Pasquali, [post 1771].
G.B. GAMBA, Galleria dei letterati ed artisti illustri delle provincie veneziane nel secolo decimottavo, II, Venezia, Alvisopoli, 1824 (= Bologna, Forni, 1975); LIRUTI, Notizie delle vite, IV, 486-488; S. DE RENZI, Storia della Medicina in Italia, I-V, Napoli, Filiatre-Sebezio, 1845-1848 (= Bologna, Forni, 1988), V, 79, 366, 535, 538, 669; A. CASTIGLIONI, Storia della medicina, Milano, Mondadori, 1936, 516-517; MARCHETTI, Friuli, 442-445; SOMEDA DE MARCO P., Medici, 131-141; G. MARCHESINI, Un illustre medico friulano del Settecento Giuseppe Antonio Pujati, «Atti dell’Accademia di scienze lettere e arti di Udine», s. VI, 9 (1949), 319-348; G. PUJATTI, La Parrocchia di Puja e i Pujatti, Pordenone, Tipografia S. Marco, 1969; P. CARACCI, Medici umanisti del cinque e seicento. Il ’700 con Pujati e Comparetti, «Il giornale del medico pratico» (Supplemento in occasione della mostra: I secoli d’oro della medicina. La scuola medica di Padova e il Friuli, 24 aprile 1987), 45-46; Anton Lazzaro Moro contributi per una ricerca, a cura di L. CRISTANTE, Pordenone, Edizioni della Provincia di Pordenone, 1988, 15, 33; L. BONUZZI, Giuseppe Antonio Pujati, in Professori e scienziati a Padova nel Settecento, a cura di S. CASELLATO - L. SITRAN REA, Treviso, Antilia, 2002 (Centro per la storia dell’Università di Padova. Profili biografici, 3), 483-486.